Vào ngày 7 tháng 9 năm 1961, một áp thấp nhiệt đới đã hình thành từ một vùng thấp ở khu vực gần rạn san hô vòng Kwajalein. Áp thấp nhiệt đới này sau đó đã mạnh lên một cách nhanh chóng, vào thời điểm những sự chỉnh sửa về vị trí của nó có thể được thực hiện, Nancy đã gần là một siêu bão. Di chuyển dần về phía Tây, áp suất của Nancy đã giảm xuống rất nhanh và đến ngày mùng 9 vận tốc gió của nó đã đạt đến ngưỡng tương đương với bão cấp 5 trong thang bão Saffir-Simpson.[1] Nó đã còn duy trì cấp độ đó trong vài ngày tiếp theo.

Một thời gian ngắn sau khi đạt cường độ tối đa, Nancy dần tiếp cận Quần đảo Ryūkyū và bắt đầu chuyển hướng. Nó đã đi qua đảo Haze và khu vực gần Okinawa. Vào khoảng thời gian này, sống áp cao cận nhiệt chi phối quỹ đạo di chuyển của Nancy bị phá vỡ, và cơn bão đã chuyển hướng đáng kể tiến về phía Nhật Bản. Vào ngày 16 tháng 9 Nancy đã đổ bộ trực tiếp vào Muroto Zaki; sau đó nó đổ bộ lần thứ hai lên đảo Honshū, khu vực gần Osaka. Cơn bão tiếp tục tăng tốc và nhanh chóng di chuyển qua hòn đảo, tốc độ di chuyển của nó cuối cùng đã lên tới 65 dặm/giờ (100 km/giờ).[2] Nancy sau đó vượt qua đảo Hokkaidō, suy yếu thành một cơn bão nhiệt đới trước khi đi vào biển Okhotsk. Đến ngày 17 Nancy đã trở thành xoáy thuận ngoại nhiệt đới. Hệ thống ngoại nhiệt đới cuối cùng đã vượt bán đảo Kamchatka và đi ra ngoài đại dương.[3]